YAMAGISHI Kenji
| Department of Chemical Biology and Applied Chemistry | Associate Professor |
Researcher Information
Field Of Study
Research activity information
Paper
- Thermodynamic Analysis of Nucleic Acid Aptamers Binding to Their Targets
Kenji Yamagishi; Taiichi Sakamoto
Netsu Sokutei, Jul. 2023, Refereed
Lead - Phylogenetic trees of closely related bacterial species and subspecies based on frequencies of short nucleotide sequences
Yoshio Nakano; Yusaku Domon; Kenji Yamagishi
PLOS ONE, Apr. 2023, Refereed
Last - 計算化学手法を用いた抗体に結合する RNA アプタマーの分子認識機構の解明
山岸賢司
月刊「細胞」, Dec. 2021, Invited
Lead - 分子シミュレーション解析を用いた抗体に結合するRNAアプタマーの結合機構の解明
山岸賢司
アグリバイオ, Sep. 2021, Invited
Lead - Synthesis and evaluation of (S)-5′-C-aminopropyl and (S)-5′-C-aminopropyl-2′-arabinofluoro modified DNA oligomers for novel RNase H-dependent antisense oligonucleotides
Yujun Zhou; Ryohei Kajino; Seiichiro Ishii; Kenji Yamagishi; Yoshihito Ueno
RSC Adv., Nov. 2020, Refereed, Not invited - Binding interaction analysis of RNA aptamer-Fc region of human immunoglobulin G using fragment molecular orbital calculation
Hisae Yoshida; Koki Sato; Takeshi Ishikawa; Taiichi Sakamoto; Kenji Yamagishi
Chemical Physics Letters, Jan. 2020, Refereed, Not invited
Corresponding - 分子動力学計算によるRNAアプタマーとヒト抗体の複合体形成におけるCa2+の役割の解析
石井 清一郎; 関口 真裕; 吉田 尚恵; 増川 恵介; 石川 岳志; 坂本 泰一; 山岸 賢司
日本コンピュータ化学会誌, Dec. 2019, Refereed, Not invited
Corresponding - Synthesis and characterization of small interfering RNAs with haloalkyl groups at their 3′-dangling ends
Akash Chandela; Taeko Watanabe; Kenji Yamagishi; Yoshihito Ueno
Bioorganic & Medicinal Chemistry, Apr. 2019, Refereed, Not invited - Synthesis and Biophysical Characterization of RNAs Containing (R)- and (S)-5′-C-Aminopropyl-2′-O-methyluridines
Ryohei Kajino; Yusuke Maeda; Hisae Yoshida; Kenji Yamagishi; Yoshihito Ueno
The Journal of Organic Chemistry, Feb. 2019, Refereed, Not invited - Synthesis of 4′-C-aminoalkyl-2′-O-methyl modified RNA and their biological properties
Kana Koizumi; Yusuke Maeda; Toshifumi Kano; Hisae Yoshida; Taiichi Sakamoto; Kenji Yamagishi; Yoshihito Ueno
Bioorganic and Medicinal Chemistry, Jul. 2018, Refereed, Not invited - Selective release of miRNAs via extracellular vesicles is associated with house-dust mite allergen-induced airway inflammation
Y. Gon; S. Maruoka; T. Inoue; K. Kuroda; K. Yamagishi; Y. Kozu; S. Shikano; K. Soda; J. Lotvall; S. Hashimoto
CLINICAL AND EXPERIMENTAL ALLERGY, Dec. 2017, Refereed, Not invited - Quantitative Determination of Glycine, Alanine, Aspartic Acid, Glutamic Acid, Phenylalanine, and Tryptophan by Raman Spectroscopy
Yasushi Numata; Maria Otsuka; Kenji Yamagishi; Hiroyuki Tanaka
ANALYTICAL LETTERS, 2017, Refereed, Not invited - Gene expression analysis in airway-secreting extracellular vesicles upon house dust mite exposure
Yasuhiro Gon; Shuichiro Maruoka; Toshio Inoue; Kenji Mizumura; Kazumichi Kuroda; Yoshihito Fukano; Kenji Yamagishi; Eriko Tsuboi; Shu Hashimoto
Allergology International, Sep. 2016, Refereed, Not invited - Exosomal messenger RNAs in the airway are potential biomarkers for acute lung injury in mice
Sotaro Shikano; Toshio Inoue; Shuichiro Maruoka; Yasuhiro Gon; Kazumichi Kuroda; Kenji Yamagishi; Kaori Soda; Eriko Tsuboi; Ikuko Takeshita; Shu Hashimoto
European Respipatory Journal, Sep. 2015, Refereed, Not invited - 創薬を視野に入れた呼吸器疾患の病態解明 -細胞外顆粒内RNA情報の臨床応用-
権 寧博; 丸岡 秀一郎; 黒田 和道; 山岸 賢司; 橋本 修
呼吸と循環, Jun. 2015, Refereed, Invited - Protein stabilization utilizing a redefined codon
Kazumasa Ohtake; Atsushi Yamaguchi; Takahito Mukai; Hiroki Kashimura; Nobutaka Hirano; Mitsuru Haruki; Sosuke Kohashi; Kenji Yamagishi; Kazutaka Murayama; Yuri Tomabechi; Takashi Itagaki; Ryogo Akasaka; Masahito Kawazoe; Chie Takemoto; Mikako Shirouzu; Shigeyuki Yokoyama; Kensaku Sakamoto
SCIENTIFIC REPORTS, May 2015, Refereed, Not invited - RNA-Sequence Analysis by Next-Generation Sequencer for the Early Diagnosis of Respiratory Disease
Yoshihito FUKANO; Yuki MIYAZAWA; Taiju MIKOSHI; Toshio INOUE; Shuuichirou MARUOKA; Kazumichi KURODA; Yasuhiro GON; Shu HASHIMOTO; Kenji YAMAGISHI
J. Comput. Chem. Jpn, Jan. 2015, Refereed, Invited
Corresponding - Establishment of Next-Generation Sequencer Data Analysis Methods and Exploration of Novel Gene Candidates
Yuki Miyazawa; Yoshihito Fukano; Taiju Mikoshi; Toshio Inoue; Syuichirou Maruoka; Kazumichi Kuroda; Gon Yasuhiro; Shu Hashimoto; Kenji Yamagishi
JCCJ, Dec. 2014, Refereed, Not invited
Corresponding - Structural Stability of Halogenated Protein: Fragment Molecular Orbital Study
Jumpei Takanohashi; Sousuke Kohashi; Takeshi Ishikawa; Kensaku Sakamoto; Kenji Yamagishi
J. Comput. Chem. Jpn, Dec. 2014, Refereed, Invited
Corresponding - RNA-seqに対するNGSデータ解析プログラムの開発
見越大樹; 深野義人; 宮澤由妃; 山岸賢司
日本コンピュータ化学会誌, Dec. 2014, Refereed, Not invited
Corresponding - Analysis of Interactions between Mutant Vitamin D Receptor and Its Ligands: Fragment Molecular Orbital Study
Hisae Yoshida; Mitsuru Haruki; Kenji Yamagishi
J. Comput. Chem. Jpn, Dec. 2014, Refereed, Not invited
Corresponding - ラット好塩基球様細胞株RBL-2H3の脱顆粒に及ぼすカゼイン由来ペプチドおよび関連アミノ酸の影響
田中守、山岸賢司、菅原卓也、廣内智子、岡本威明
日本食品科学工学会誌, Oct. 2012, Refereed, Not invited - Effect of Electron Density on the Indole Ring of Tryptophan Derivatives on Transcriptional Regulation of Indoleamine 2,3-Dioxygenase (IDO)
Kenji Yamagishi; Yu Kuzuoka; Fumiyuki Yamakura; Takeaki Okamoto
ChemMedChem, Sep. 2012, Refereed, Not invited
Lead - Differential Expression and Function of Alternative Splicing Variants of Human Liver X Receptor α.
Kaori Endo-Umeda; Shigeyuki Uno; Ko Fujimori; Yoshikazu Naito; Koichi Saito; Kenji Yamagishi; Yangsik Jeong; Hiroyuki Miyachi; Hiroaki Tokiwa; Sachiko Yamada; Makoto Makishima
Mol Pharmacol, Apr. 2012, Refereed, Not invited - Impact of Peptides from Casein and Peptide-Related Amino Acids on Degranulation in Rat Basophilic Leukemia Cell Line RBL-2H3
Mamoru Tanaka; Kenji Yamagishi; Sugahara Takuya; Tomoko Hirouchi; Takeaki Okamoto
JOURNAL OF THE JAPANESE SOCIETY FOR FOOD SCIENCE AND TECHNOLOGY-NIPPON SHOKUHIN KAGAKU KOGAKU KAISHI, 2012, Refereed, Not invited - リガンドを介した1α,25(OH)2D3/VDRのアロステリックコミュニケーション
元吉沙也加、山岸賢司、槇島誠、山田幸子、常盤広明
ビタミン, Nov. 2010, Refereed, Not invited - Flexible ligand recognition of peroxisome proliferator-activatedd receptor-γ (PPARγ)
Kenji Yamagishi; Keiko Yamamoto; Yuji Mochizuki; Tatsuya Nakano; Sachiko Yamada; Hiroaki Tokiwa
Bioorganic & Medicinal Chemistry Letters, Aug. 2010, Refereed, Not invited
Lead - Interactions Between 1α,25(OH)2D3 and Residues in the Ligand-Binding Pocket of the Vitamin D Receptor: A Correlated Fragment Molecular Orbital Study
Kenji Yamagishi; Hiroaki Tokiwa; Makoto Makishima; Sachiko Yamada
Journal of Steroid Biochemistry and Molecular Biology, Jun. 2010, Refereed, Not invited
Lead - Ligand-Dependent Conformational Change Reflects Steric Structure and Interactions of a vitamin D receptor/Ligand Complex: A Fragment Molecular Orbital Study
Sayaka Motoyoshi; Kenji Yamagishi; Sachiko Yamada; Hiroaki Tokiwa
Journal of Steroid Biochemistry and Molecular Biology, Jun. 2010, Refereed, Not invited - トリプトファン誘導体の indoleamine2,3-dioxygenase (IDO)転写調節機能
岡本威明、山岸賢司、叶内宏明、常盤広明、日高和夫
生物機能研究会誌13, Mar. 2010, Refereed, Not invited - Effect of electron density on the indole ring of tryptophan derivatives on transcriptional regulation of indoleamine 2,3-dioxygenase (IDO)
Takeaki Okamoto; Kenji Yamagishi; Kotomi Aso; Fumiyuki Yamakura; Hiroaki Tokiwa; Shigenobu Tone; Kazuo Hidaka
Kawasaki Ikaishi Arts & Sci, Feb. 2009, Refereed, Not invited - Ab initio fragment molecular orbital study of ligand binding to human progesterone receptor ligand-binding domain
Takanori Harada; Kenji Yamagishi; Tatsuya Nakano; Kazuo Kitaura; Hiroaki Tokiwa
Naunyn-Schmiedeberg’s Archives of Pharmacology, Sep. 2008, Refereed, Not invited - QSAR Study of Cyclic Urea Type HIV-1 PR Inhibitors Using Ab Initio MO Calculation of Their Complex Structure with HIV-I PR
Tatsusada Yoshida; Kenji Yamagishi; Hiroshi Chuman
QSAR & Combinatorial Science, Aug. 2008, Refereed, Not invited - Frontier Simulation Software for Industrial Science
Chisachi Kato; Makoto Tsubokura; Yuji Mochizuki; Katsumi Yamashita; Tadashi Murase; Kenji Yamagishi; Hiroaki Tokiwa; Tatsuya Nakano; Takenori Yamamoto; Takashisa Ohno
Annual Report of the Earth Simulator Center, Apr. 2007, Not refereed, Not invited - Vitamin D Receptor: Ligand Recognition and Allosteric Network
Keiko Yamamoto; Daijiro Abe; Nobuko Yoshimoto; Mihwa Choi; Kenji Yamagishi; Hiroaki Tokiwa; Masato Shimizu; Makoto Makishima; Sachiko Yamada
Journal of Medicinal Chemistry, Aug. 2006, Refereed, Not invited - Functions of key residues in the ligand-binding pocket of vitamin D receptor: Fragment molecular orbital-interfragment interaction energy analysis
Kenji Yamagishi; Keiko Yamamoto; Sachiko Yamada; Hiroaki Tokiwa
Chemical Physics Letters, Mar. 2006, Refereed, Not invited
Lead
MISC
- Phylogenetic trees of closely related bacterial species and subspecies based on frequencies of short nucleotide sequences
Yoshio Nakano; Yusaku Domon; Kenji Yamagishi
BioRxiv, May 2022 - 計算化学によるRNAアプタマーと標的タンパク質との分子間相互作用解析
山岸賢司
アグリバイオ, 29 May 2020, Refereed, Invited
Lead - RNAアプタマーの分子認識メカニズムの解明
山岸賢司
月刊「細胞」, 23 Apr. 2020, Refereed, Invited
Lead - 計算化学を用いたRNAアプタマーの分子設計手法の確立に向けて
山岸賢司・吉田尚恵
SAR News, 01 Apr. 2020, Refereed, Invited
Lead - Theoretical study on the structure and dynamics of RNA aptamer to human immunoglobulin G
吉田尚恵; 吉田尚恵; 関口真裕; 秋田一雅; 猪股恵美礼; 石川岳志; 坂本泰一; 山岸賢司
化学系学協会東北大会プログラムおよび講演予稿集, 2017 - 気道分泌型エクソソーム
権 寧博; 丸岡秀一郎; 黒田和道; 深野義人; 山岸賢司; 橋本 修
臨床免疫・アレルギー科, 2015, Not refereed, Not invited - Effects of peptides derived from milk on degranulation in rat basophilic leukemia RBL-2H3 cells
OKAMOTO Takeaki; TANAKA Mamoru; YAMAGISHI Kenji; SUGAHARA Takuya
Abstracts of Annual Congress of The Japan Society of Home Economics, 2012, Not refereed, Not invited - トリプトファン誘導体のIDO転写調節に及ぼすインドール環上の電荷密度の影響
岡本威明; 山岸賢司; 麻生琴未; 山倉文幸; 常盤広明; 刀祢重信; 日高和夫
川崎医学会誌 一般教養篇, 30 Jan. 2010, Not refereed, Not invited - Development and its Application of in silico Drug Design Based on Ab initio Docking Method
Sayaka Motoyoshi; Kenji Yamagishi; Sachiko Yamada; Hiroaki Tokiwa
YAKUGAKU ZASSHI, Aug. 2008, Not refereed, Not invited - Quantitative Structure-Activity Relationship Analysis for HIV-1 PR Inhibitors including Dynamical Conformation Change
Misato Kawawada; Kenji Yamagishi; Hiroyuki Teramae; Hiroshi Chuman; Hiroaki Tokiwa
YAKUGAKU ZASSHI, Nov. 2004, Not refereed, Not invited
Books and other publications
- タンパク質の構造解析手法と In silicoスクリーニングへの応用事例
山岸賢司; 石川岳志, Joint work, 第8節 生体分子シミュレーションによる核酸医薬品開発への展開
技術情報協会, Jul. 2023
9784861049712 - mRNAの制御機構の解明と治療薬・ワクチンへの活用
山岸賢司; 坂本泰一, Joint work, 第6節 RNAの立体構造と計算化学－
技術情報協会, Feb. 2023
9784861049378 - ホットトピックス,「分子シミュレーション解析を用いた機能性核酸分子の設計」
Single work, ホットトピックス, 山岸賢司
CBI学会, Sep. 2020 - 化学と工業,「東北支部」郡山地区の化学普及活動
Single work, 日本化学会支部だより
日本化学会, Dec. 2019 - 化学現象から学ぶ化学の数学 -基礎から応用まで-
内野智裕; 小林以弦; 沼田靖; 根本修克; 山岸賢司, Joint work, 内野智裕,小林以弦,沼田靖,根本修克,山岸賢司
オーム社, Aug. 2018, Not refereed
9784274221927 - 「in silico創薬におけるスクリーニングの高速化・高精度化技術」
山岸賢司; 坂本泰一, Joint work, 第１章３節「In-silicoを用いたタンパク質―アプタマーの相互作用解析と分子設計」, 山岸賢司,坂本泰一
技術情報協会, Jan. 2018, Not refereed
9784861046889 - IR分析 テクニック事例集～２６０分析事例を解説！ ～
監修 奥村治樹; 分担執筆; 沼田 靖; 山岸 賢司; 田中 裕之, Joint work, 第2部11章10節から12節, 監修 奥村治樹; 分担執筆 沼田 靖、山岸 賢司、田中 裕之
技術情報協会, Oct. 2013, Not refereed - 国立環境研究所スーパーコンピューター利用研究年報・平成21年度
常盤広明; 青木康展; 山田幸子; 山岸賢司, Joint work, 117-123, 常盤広明; 青木康展; 山田幸子; 山岸賢司
国立環境研究所, Jun. 2010, Not refereed
Lectures, oral presentations, etc.
- Improvement of binding activity of an aptamer that binds to IgG1 by chemical modification and in silico analysis of dynamics of the aptamer
Akari Endo; Masahiro Sekiguchi; Takeshi Ishikawa; Kenji Yamagishi; Taiichi Sakamoto
XXV International Round Table on Nucleosides, Nucleotides and Nucleic Acids（IRT2024） - AML1タンパク質に結合するアプタマーの構造活性相関の研究
隈谷龍成; 田中淳; 坂本泰一; 山岸賢司
日本蛋白質科学会年会 - 【依頼公演】バイオインフォマティクス手法によるライフサイエンス研究
山岸賢司
第20回RNA工学セミナー（千葉工業大学） - IgG1に対するRNA aptamerとChimera aptamerの構造特性の比較
長谷川 拓矢; 阪本智樹; 関口真裕; 石川岳志; 片平正人; 永田崇; 山岸賢司; 坂本泰一
第46回日本分子生物学会 - 抗体に結合するaptamerの改変体の結合能の解析
遠藤朱梨,関口真裕,阪本智樹,堀内正隆,石川岳志,片平正人,永田崇,山岸賢司,坂本泰一
第46回日本分子生物学会 - Conformational behavior, dynamics, and affinity of A18-modified aptamers toward human Immunoglobulin G
Ozora Kudo; Akari Endo; Masahiro Sekiguchi; Azumi ito; Takeshi Ishikawa; Taiichi Sakamoto; Kenji Yamagishi
CBI学会2023年大会 - 肝臓免疫細胞におけるVDR依存性の機能発現の解析
槙島誠,梅田香織,山口凉香,山岸賢司
第377回脂溶性ビタミン総合研究委員会, Sep. 2023 - Akari Endo, Azumi Ito, Masahiro Sekiguchi, Tomoki Sakamoto, Masato Katahira, Takashi Nagata, Takeshi Ishikawa, Kenji Yamagishi, Taiichi Sakamoto
Effect of modification on; he; amer; ha; IgG; International; Symposium of; Advanced Energy Science
The 14th International Symposium of Advanced Energy Science - 抗体に結合するaptamerの改変体の結合能の解析
遠藤朱梨; 伊藤愛純; 関口真裕; 阪本智樹; 片平正人; 永田崇; 石川岳志; 山岸賢司; 坂本泰一
2023年度日本生化学会関東支部例会, Jun. 2023 - 【依頼講演】計算化学を用いたアプタマーの革新的デザイン技術
山岸賢司
ｲﾉﾍﾞｰｼｮﾝｼﾞｬﾊﾟﾝ／JST事業採択課題展示特別枠, Oct. 2022, Invited - Conformational behavior and dynamics of G7A mutant IgG-aptamer
Seiichiro Ishii; Ryoji Yamazaki; Oozora Kudo; Taiichi Sakamoto; Takeshi Ishikawa; Kenji Yamagishi
CBI学会2022年大会, Oct. 2022 - Effect of chemical modification on the aptamer that binds to IgG
Azumi Ito; Yuuki Yatabe; Hisae Yoshida; Masahiro Sekiguchi; Kazumasa Akita; Yoshikazu Nakamura; Yusuke Nomura; Takeshi Ishikawa; Kenji Yamagishi; Taiichi Sakamoto
第60回日本生物物理学会年会, Sep. 2022 - In silico approach for identification of the thermodynamic profiles of aptamer–IgG binding
Ryoji Yamagzaki,Azumi Ito,Tomoki Sakamoto,Masaki Komine,Takeshi Ishikawa,Masato Katahira,Takashi Nagata,Taiichi Sakamoto, Kenji Yamagihi
第60回日本生物物理学会年会, Sep. 2022 - Effect of chemical modification on the aptamer that binds to IgG，Improvement of binding activity by introducing chemical modification to the aptamer that binds to IgG
Azumi Ito; Yuuki Yatabe; Hisae Yoshida; Masahiro Sekiguchi; Kazumasa Akita; Yoshikazu Nakamura; Yusuke Nomura; Takeshi; Ishikawa; Kenji Yamagishi; Taiichi Sakamoto
The 13th International Symposium of Advanced Energy Science, Sep. 2022 - 生体分子シミュレーション,ー核酸医薬品開発への展開ー
山岸賢司
第4回ファーマラボEXPO「アカデミックフォーラム」, Jul. 2022 - 【依頼講演】核酸・タンパク質などの生体高分子の分子シミュレーション
山岸賢司
福島地区・高分子学会東北支部講演会, Mar. 2022, Invited - 【依頼講演】RNAの立体構造および相互作用の計算化学
山岸賢司
mRNAターゲット創薬研究機構「2021年度 第2回講演会」, Feb. 2022, Invited - RNAアプタマーのDNA置換の物理化学的解析
坂本 泰一; 山岸 賢司
第44回日本分子生物学会年会「ワークショップ：アプタマー研究の最前線」, Dec. 2021 - 分子動力学計算による抗体に結合するRNAアプタマーの立体構造解析
山崎凌司,山岸賢司
日本コンピュータ化学会2021年秋季年会, Nov. 2021 - 【依頼講演】,計算化学を基盤としたアプタマーの論理的な設計指針の確立を目指して
山岸賢司
化学系学協会東北大会, Oct. 2021 - 分子動力学計算を用いたIgGアプタマーの構造ダイナミクスの塩基配列・塩基修飾依存性
金沢拓土; 金田一樹; 山岸賢司
化学系学協会東北大会, Oct. 2021 - デオキシリボヌクレオチドとリボヌクレオチドの違いによるIgG アプタマーの結 合プロファイルの解析
山崎凌司; 金田一樹; 吉田尚恵; 坂本泰一; 石川岳志; 山岸賢司
化学系学協会東北大会, Oct. 2021 - 分子シミュレーションを用いたヒト抗体(IgG)に特異的に結合する新規修飾アプタマーの分子設計
金田一樹; 石 井清一郎; 坂本泰一; 石川岳志; 山岸賢司
化学系学協会東北大会, Oct. 2021 - Molecular Dynamics Simulation of the Effect that Ca2+ has on the Tertiary Structure of an RNA Aptamer
Kazuki Kaneda; Seiichiro Ishii; Hisae Yoshida; Takeshi Ishikawa; Taiichi Sakamoto; Kenji Yamagishi
第２０回日本蛋白質科学会年会, Jul. 2020, Not invited - AR技術を用いた分子構造表示システムの開発
武田伊織,山岸賢司
情報処理学会 第８２回全国大会, Mar. 2020, Not invited - Phylogenetic classifier of bacterial genomes based on nucleotide pentamer profiles
中野善夫,土門優作,山岸賢司,渡辺孝康
第93回日本細菌学会総会, Feb. 2020, Not invited - 分子構造への理解を深めるAR学習システムの開発
武田伊織・山岸賢司
第６２回日本大学工学部学術研究報告会, Dec. 2019, Not invited - AML1およびIgGに対するRNAアプタマーの結合メカニズムの解析
増川恵介、田中淳、吉田尚恵、山岸賢司
第６２回日本大学工学部学術研究報告会, Dec. 2019, Not invited - 抗体に結合するアプタマーと金属イオンの相互作用解析
古峰真樹,吉田尚恵,関口真裕,石川岳志,山岸賢司,坂本泰一
第42回日本分子生物学会年会, Dec. 2019, Not invited - Phylogenetic Analysis of Bacterial Genomes Based on Frequencies of Nucleotide N-gram Profiles
土門優作,山岸賢司,中野善夫
第42回日本分子生物学会年会, Dec. 2019, Not invited - 分子シミュレーションによるRNAアプタマー- IgG複合体の相互作用解析および複合体形成におけるCa2+の影響
石井清一郎,吉田尚恵,増川恵介,石川岳志,坂本泰一,山岸賢司
日本コンピュータ化学会2019秋季年会, Oct. 2019, Not invited - Combined computational and experimental study on the binding mechanism of RNA aptamer to human Immunoglobulin G
Keisuke MASUKAWA; Hisae YOSHIDA; Seiichiro ISHII; Yuuki Yatabe; Takeshi Ishikawa; Taiichi Sakamoto; Kenji Yamagishi
CBI（情報計算化学生物）学会2019年大会, Oct. 2019, Not invited - 分子動力学計算を用いた修飾核酸の立体構造解析
山崎翔,吉田尚恵,増川恵介,石井清一郎,山岸賢司
第57回 日本薬学会東北支部大会, Oct. 2019, Not invited - バイオインフォマティクス研究における種々のライフサイエンスデータベースの高度利用
石井清一郎; 土門優作; 吉田尚恵; 武田伊織; 小野洋一; 中野善夫; 山岸賢司
トーゴーの日 －バイオデータベース：つないで使う－, Oct. 2019, Not invited - Binding mechanism between RNA aptamer and target molecule toward the development of novel RNA aptamers
Keisuke MASUKAWA; Hisae YOSHIDA; Seiichiro ISHII; Yuuki YATABE; Takeshi ISHIKAWA; Taiichi SAKAMOTO; Kenji YAMAGISHI
RNA Frontier Meeting 2019, Sep. 2019, Not invited - Binding mechanism of RNA aptamer and human immunoglobulin G (IgG) by Molecular Simulation
Seiichiro ISHII; Kenji YAMAGISHI
RNA Frontier Meeting 2019, Sep. 2019, Not invited - Dynamic Structure-Activity Relationship for AML1 Aptamers
Atsushi TANAKA; Kenji YAMAGISHI
RNA Frontier Meeting 2019, Sep. 2019, Not invited - AR技術を用いた分子構造学習教材の開発
武田伊織; 山岸賢司
化学系学協会東北大会, Sep. 2019, Not invited - クラスター解析を用いたMDトラジェクトリー解析プロトコルの構築と応用
土門優作,増川恵介,金田一樹,佐藤壱成; 山岸賢司
化学系学協会東北大会, Sep. 2019, Not invited - Correlation between dynamic structure and binding affinity of AML1 aptamer
田中淳、増川恵介、吉田尚恵、石川岳志、坂本泰一、山岸賢司
第19回日本蛋白質科学会年会, Jun. 2019, Not invited - Binding mechanism between RNA aptamer and target molecule
増川恵介、吉田尚恵、田中淳、石井清一郎、矢田部優貴、石川岳志、坂本泰一、山岸賢司
第19回日本蛋白質科学会年会, Jun. 2019, Not invited - フラバノン配糖体の消化による抗アレルギー活性の発現に関する研究
白土心、田中守、山岸賢司、岡本威明
第23回 生物機能研究会, Jun. 2019, Not invited - 分子動力学計算によるIgGアプタマーの構造特性の解析
日本化学会第99回春季大会
日本化学会第99回春季大会, Mar. 2019, Not invited - 塩基配列依存的なRNAの構造特性と機能との相関
増川恵介・吉田尚恵・山岸賢司
第６１回日本大学工学部学術研究報告会, Dec. 2018, Not invited - AR技術を用いた照合型分子構造表示システムの開発
武田伊織・山岸賢司
第６１回日本大学工学部学術研究報告会, Dec. 2018, Not invited - 抗体に結合する化学修飾アプタマーの熱力学的解析
矢田部優貴・吉田尚恵・関口 真裕・秋田一雅・猪股恵美礼・野村祐介・石川岳志・山岸賢司・坂本泰一
第41回日本分子生物学会年会, Nov. 2018, Not invited - 【招待講演】,分子シミュレーション解析を用いた生体分子の構造と機能の解明
山岸賢司
第1回SPERC計算化学講演会,第3回岩手量子化学計算講演会, Nov. 2018, 岩手大学理工学部附属ソフトパス理工学研究センター（ＳＰＥＲＣ）,岩手量子化学計算研究会, Invited - 分子シミュレーション解析を用いた生体分子の構造と機能の解明【招待講演】
山岸賢司
第1回SPERC計算化学講演会 第3回岩手量子化学計算講演会, Nov. 2018, 岩手大学理工学部附属ソフトパス理工学研究センター（ＳＰＥＲＣ） 岩手量子化学計算研究会, Invited - ライフサイエンスデータベースを利活用したバイオインフォマティクス研究
渡邊妙子; 吉田尚恵; 武田伊織; 小野洋一; 中野善夫; 山岸賢司
トーゴーの日 －バイオデータベース：つないで使う－, Oct. 2018, Not invited - 化学教育への展開を目指した分子構造AR表示システムの開発
武田伊織; 山岸賢司
化学系学協会東北大会, Sep. 2018, Not invited - MECHANISM OF MOLECULAR RECOGNITION OF RNA APTAMER TO HUMAN IMMUNOGLOBULIN G
Hisae YOSHIDA; Takeshi ISHIKAWA; Taiichi SAKAMOTO; Kenji YAMAGISHI
EFMC-ISMC 2018 [XXV EFMC International Symposium on Medicinal Chemistry], Sep. 2018, Not invited - 分子動力学計算による修飾核酸オリゴマーの立体構造解析
山崎翔・関口真裕・山岸賢司
日本化学会第98春季年会, Mar. 2018, Not invited - RNA アプタマーとAML1 タンパク質の結合メカニズムに対する分子シミュレーション解析
増川恵介・関口真裕・山岸賢司
日本化学会第98春季年会, Mar. 2018, Not invited - RNAアプタマーと標的タンパク質の分子間相互作用解析
吉田尚恵・山岸賢司・都築誠二
SATテクノロジー・ショーケース2018, Feb. 2018, Not invited - 生体分子シミュレーション
山岸賢司
第６０回日本大学工学部学術研究報告会, Dec. 2017, Not invited - 分子動力学シミュレーションによる修飾核酸の動的構造解析
関口真裕・山岸賢司
第６０回日本大学工学部学術研究報告会, Dec. 2017, Not invited - Structure and Dynamics of RNA Aptamer to Human Immunoglobulin G
Hisae Yoshida; Masahiro Sekiguchi; Keisuke Masukawa; Sho Yamazaki; Emire Inomata; Kazumasa Akita; Takeshi Ishikawa; Taiichi Sakamoto; Kenji Yamagishi
CBI（情報計算化学生物）学会2017年大会, Oct. 2017, Not invited - 【依頼講演】,生体分子系に対する分子シミュレーション解析
山岸賢司
化学系学協会東北大会, Sep. 2017, Invited - 生体分子系に対する分子シミュレーション解析
山岸賢司
化学系学協会東北大会, Sep. 2017, Invited - Theoretical study on the structure and dynamics of RNA aptamer to human immunoglobulin G
Hisae YOSHIDA; Masahiro SEKIGUCHI; Kazumasa AKITA; Emire INOMATA; Takeshi ISHIKAWA; Taiichi SAKAMOTO; Kenji YAMAGISHI
化学系学協会東北大会, Sep. 2017, Not invited - IN SILICO DESIGN OF RNA APTAMER TO HUMAN IMMUNOGLOBULIN G
Hisae Yoshida; Masahiro Sekiguchi; Kazumasa Akita; Emire Inomata; Takeshi Ishikawa; Taiichi Sakamoto; Kenji Yamagishi
7th edition of the EFMC International Symposium on Advances in Synthetic and Medicinal Chemistry (EFMC-ASMC’17), Aug. 2017, Not invited - In silico design of RNA aptamer to human Immunoglobulin G
吉田尚恵; 関口真裕; 秋田一雅; 猪股恵美礼; 野村祐介; 石川岳志; 坂本泰一; 山岸賢司
第17回日本蛋白質科学会年会, Jun. 2017, Not invited - 分子動力学計算を用いた修飾RNAアプタマーの立体構造解析
関口真裕; 吉田尚恵; 石川岳志; 山岸賢司
第５９回日本大学工学部学術研究報告会, Dec. 2016, Not invited - 分子動力学計算を用いた修飾RNAアプタマーの構造解析
関口真裕; 小野間優希; 吉田尚恵; 秋田一雅; 猪股恵美礼; 石川岳志; 坂本泰一; 山岸賢司
日本核酸医薬学会第2回年会, Nov. 2016, Not invited - Molecular Simulation Analysis of RNA Aptamer to Human Immunoglobulin G
Hisae Yoshida; Toshiki Fukaya; Masahiro Sekiguchi; Emire Inomata; Kazumasa Akita; Takeshi Ishikawa; Taiichi Sakamoto; Kenji Yamagishi
Chem-Bio Informatics Society(CBI) Annual Meeting 2016, Oct. 2016, Not invited - 生体分子シミュレーションによるアプタマーの最適化
山岸賢司
CBI学会2016年大会, Oct. 2016, Invited - 修飾RNA アプタマーに対する構造活性相関
関口真裕・小野間優希・深谷和紀・八巻雷士・吉田尚恵・石川岳志・秋田一雅・猪股恵美礼・坂本泰一・山岸賢司
第５５回日本薬学会東北支部大会, Sep. 2016, Not invited - AR 技術を用いた分子構造表示システムの開発と薬学教育への応用
八巻雷士・山岸賢司
第５５回日本薬学会東北支部大会, Sep. 2016, Not invited - Mechanism of the structural stability of halogenated proteins
関口真裕、吉田尚恵、石川岳志、宮川伸、坂本泰一、山岸賢司
第16回日本蛋白質科学会年会, Jun. 2016, Not invited - ビタミンD 受容体のリガンド認識メカニズムの解明
吉田尚恵、春木満、山岸賢司
第16回日本蛋白質科学会年会, Jun. 2016, Not invited - Mechanism of the structural stability of halogenated proteins
吉田尚恵、石川岳志、小橋創介、鷹嘴潤平、春木満、坂本健作、山岸賢司
第16回日本蛋白質科学会年会, Jun. 2016, Not invited - 分子シミュレーションを利用したRNAアプタマーと標的タンパク質との結合メカニズムの解析
吉田尚恵・関口真裕・石川岳志・宮川伸・坂本泰一・山岸賢司
日本化学会第96春季年会2016, Mar. 2016, Not invited - 計算化学手法を用いた新規 RNA アプタマーの設計手法の開発
吉田尚恵・関口真裕・石川岳志・坂本泰一・沼田靖・山岸賢司
第５８回日本大学工学部学術研究報告会, Dec. 2015, Not invited - マウス喘息モデルにおける気道分泌型細胞外小胞RNAの網羅的発現解析
権寧博、井上寿男、深野義人、山岸賢司、黒田和道、鹿野壮太郎、曽田香織、水村賢司、丸岡秀一郎、橋本修
アレルギー・好酸球研究会2015, Oct. 2015, Not invited - ANALYSIS OF INTERACTIONS BETWEEN MUTANT VITAMIN D RECEPTOR AND ITS LIGANDS: FRAGMENT MOLECULAR ORBITAL STUDY
Kenji Yamagishi; Hisae Yoshida; Mitsuru Haruki
Frontiers in Medicinal Chemistry (FMC2015), Sep. 2015, Not invited - マウス喘息モデルを用いた気道分泌型exosomeの解析
権 寧博、丸岡秀一郎、黒田和道、山岸賢司、鹿野壮太郎、曽田香織、坪井絵莉子、竹下郁子、橋本 修
第64回日本アレルギー学会学術大会, May 2015, Not invited - マウスLPS誘導性肺障害におけるBALF中エクソソームのRNA発現解析
井上寿男、権 寧博、丸岡秀一郎、鹿野壮太郎、黒田和道、山岸賢司、曽田香織、橋本 修
第55回日本呼吸器学会学術講演会, Apr. 2015, Not invited - 次世代シークエンサーのデータ解析システムの構築と応用
深野義人,宮澤由妃,河澄恭平,山岸 賢司
平成26年度日本大学学長特別研究成果報告会-高齢化社会におけるインフルエンザ感染および重症化対策の総合的研究-公開シンポジウム, Mar. 2015, Not invited - 次世代シーケンサーを用いたRNA-seq解析手法の確立と呼吸器疾患症早期診断システムへの展開
深野義人; 宮澤由妃; 見越大樹; 井上寿男; 丸岡秀一郎; 黒田和道; 権寧博; 橋本修; 山岸賢司
生命医薬情報学連合大会2014, Oct. 2014, Not invited - 非天然型アミノ酸の導入によるタンパク質の耐熱化メカニズムの解明
Sousuke Kohashi; Jumpei Takanohashi; Takeshi Ishikawa; Haruki Mitsuru; Kensaku Sakamoto; Kenji Yamagishi1
生命医薬情報学連合大会2014, Oct. 2014, Not invited - RNA-seqに対するNGSデータ解析プログラムの開発
見越大樹; 深野義人; 宮澤由妃; 山岸賢司
日本コンピュータ化学会2014秋季年会, Oct. 2014, Not invited - NGSデータ解析環境の導入と新規遺伝子候補の探索
宮澤 由妃; 深野 義人; 見越 大樹; 井上 寿男; 丸岡秀一郎; 黒田 和道; 権 寧博; 橋本 修; 山岸 賢司
日本コンピュータ化学会2014秋季年会, Oct. 2014, Not invited - FMO法を用いた核内受容体‐リガンド間の相互作用解析
吉田 尚惠; 春木 満; 山岸 賢司
日本コンピュータ化学会2014秋季年会, Oct. 2014, Not invited - 次世代シーケンサーを用いたRNA-seq解析手法の確立と呼吸器疾患症早期診断システムへの展開II
深野 義人; 宮澤 由妃; 見越 大樹; 井上 寿男; 丸岡秀一郎; 黒田 和道; 権 寧博; 橋本 修; 山岸 賢司
日本コンピュータ化学会2014秋季年会, Oct. 2014, Not invited - ハロゲン原子導入によるタンパク質の構造安定化メカニズムの解明
鷹觜 潤平; 小橋 創介; 石川 岳志; 坂本 健作; 山岸 賢司
日本コンピュータ化学会2014秋季年会, Oct. 2014, Not invited - 高精度量子化学(QM)計算を用いた生体分子系への応用
山岸賢司
第３回RNA工学セミナー（千葉工業大学）, Sep. 2014, Not invited - Multiple site-selective integrations of bulky halogenated tyrosines enhance protein stability
Kazumasa Ohtake; Atsushi Yamaguchi; Mitsuru Haruki; Kenji Yamagishi; Kazutaka Murayama; Mikako Shirouzu; Shigeyuki Yokoyama; Kensaku Sakamoto
第52回日本生物物理学会年会, Sep. 2014, Not invited - マウスLPS誘導性肺障害における気管支肺胞洗浄液中エクソソームのRNA発現解析
井上寿男,権寧博,黒田和道,山岸賢司,鹿野壮太郎,丸岡秀一郎,曽田香織,坪井絵莉子,竹下郁子,橋本修
第６回日本RNAi研究会・第1回細胞外小胞学会, Aug. 2014, 日本RNAi研究会, Not invited - エクソソームとバイオインフォマティクス情報を利用した呼吸器疾患診断システムの開発
井上寿男、権寧博、黒田 和道、山岸賢司、丸岡秀一郎、曽田香織、坪井絵莉子、竹下郁子、橋本修
平成２６年度日本大学学部連携ポスターセッション, Jul. 2014, Not invited - 次世代シークエンサーのデータ解析システムの構築と応用
山岸賢司
平成25年度日本大学学長特別研究成果報告会公開シンポジウム-高齢化社会におけるインフルエンザ感染および重症化対策の総合的研究-, Mar. 2014, Not invited - マルチスケールシミュレーションによるタンパク質の構造機能解析
山岸賢司
平成25年度日本大学学部連携＆研究成果ポスターセッション, Dec. 2013, Not invited - エクソソームを用いた呼吸器感染症バイオマーカーの探索
橋本修、権寧博、黒田和道、山岸賢司、丸岡秀一郎、井上寿男、曽田香織、坪井絵莉子、竹下郁子
平成25年度日本大学学部連携＆研究成果ポスターセッション, Dec. 2013, Not invited - ラマン分光法を用いたバイオマス糖化プロセスにおける糖分子量測定法の開発
渡部 孝祐、河澄 恭平、山岸 賢司、沼田 靖、田中 裕之
第24回廃棄物資源循環学会研究発表会, Nov. 2013, Not invited - ラマン分光法による食品廃棄物中に含まれるタンパク質の定量分析法の開発
大塚 麻莉亜、河澄 恭平、沼田 靖、山岸 賢司、田中 裕之
第24回廃棄物資源循環学会研究発表会, Nov. 2013, Not invited - Theoretical study on structural stability of Glutathione S transferase
Sosuke Kohashi; Kenji Yamagishi; Mitsuru Haruki; Kensaku Sakamoto
International Symposium for the 70th Anniversary of the Tohoku Branch of the Chemical Society of Japan, Sep. 2013, Not invited - Quantitative analysis of solute in binary solution using Raman spectroscopy
Ryutaro Sudo; Yasushi Numata; Kenji Yamagishi; Hiroyuki Tanaka
International Symposium for the 70th Anniversary of the Tohoku Branch of the Chemical Society of Japan, Sep. 2013, Not invited - Development of method for quantitative analysis of amino acid with Raman spectroscopy
Maria Otsuka; Kyohei Kawasumi; Kenji Yamagishi; Yasushi Numata; Hiroyuki Tanaka
International Symposium for the 70th Anniversary of the Tohoku Branch of the Chemical Society of Japan, Sep. 2013, Not invited - ラマン分光法を用いた糖重合体における分子量測定法の開発
渡部孝祐、河澄恭平、山岸賢司、沼田靖、田中裕之
第60回日本食品化学工学会, Aug. 2013, Not invited - ラマン分光法を用いた2成分系アミノ酸混合溶液の定量分析法の開発
大塚麻莉亜、河澄恭平、沼田靖、山岸賢司、田中裕之
第22回環境化学討論会, Jul. 2013, Not invited - ラマン分光法を用いた糖の分子量測定法の開発
渡部孝祐、河澄恭平、山岸賢司、沼田靖、田中裕之
第22回環境化学討論会, Jul. 2013, Not invited - Effect of Electron Density on the Indole Ring of Tryptophan Derivatives on Transcriptional Regulation of Indoleamine 2,3-Dioxygenase (IDO)
Kenji Yamagishi; Yu Kuzuoka; Fumiyuki Yamakura; Takeaki Okamoto
International Society of Medicinal Chemistry, Sep. 2012, Not invited - 核内受容体を介した遺伝子転写機構の解明
山岸賢司
第５４回日本大学工学部学術研究報告会, Dec. 2011, Not invited - インフルエンザウイルスRNAポリメラーゼに関する理論的研究
山岸賢司、立石奈津美、池田潔、鈴木康夫、常盤広明
日本薬学会第131年会, Mar. 2011, Not invited - 第一原理計算に基づく新規ドッキング法の開発とその応用
元吉沙也加; 山岸賢司; 山田幸子; 常盤広明
日本薬学会第131年会, Mar. 2011, Not invited - 作用選択的なビタミンDリガンドに関する理論的研究 ４
元吉沙也加; 山岸賢司; 山田幸子; 槇島誠; 常盤広明
日本薬学会第131年会, Mar. 2011, Not invited - QM／MM‐法を用いたシアル酸誘導体の理論的解析
山藤歩; 伊東祐仁; 山岸賢司; 池田潔; 常盤広明
日本薬学会第131年会, Mar. 2011, Not invited - PPARsのデュアルおよびパンアゴニストに関する理論的研究 ２
花田典佳; 山岸賢司; 宮地弘幸; 常盤広明
日本薬学会第131年会, Mar. 2011, Not invited - ヒトパラインフルエンザウイルス（hPIV）感染症新規治療薬の理論的分子設計
伊東祐仁; 山岸賢司; 池田潔; 鈴木隆; 常盤広明
日本薬学会第131年会, Mar. 2011, Not invited - FMO法を用いた抗インフルエンザ薬とNAとの理論的相互作用解析
酒井美帆; 山岸賢司; 鈴木康夫; 常盤広明
日本薬学会第131年会, Mar. 2011, Not invited - Ab initio quantum chemical interaction analysis between influenza neuraminidase and anti-influenza drugs using novel computer-assisted procedure
Kenji Yamagishi; Miho Sakai; Yasuo Suzuki; Hiroaki Tokiwa
The 2010 International Chemical Congress of Pacific Basin Societies, Dec. 2010, Not invited - Theoretical study of agonist ligands of the vitamin D receptor
Sayaka Motoyoshi; Kenji Yamagishi; Sachiko Yamada; Makoto Makishima; Hiroaki Tokiwa
The 2010 International Chemical Congress of Pacific Basin Societies, Dec. 2010, Not invited - Ab initio fragment molecular orbital study on novel antiparainfluenza drugs
Yuji Itoh; Kenji Yamagishi; Kiyoshi Ikeda; Takashi Suzuki; Hiroaki Tokiwa
The 2010 International Chemical Congress of Pacific Basin Societies, Dec. 2010, Not invited - ヒトパラインフルエンザウイルス（hPIV）感染症新規治療薬の理論的分子設計３
伊東祐仁、山岸賢司、池田潔、鈴木隆、常盤広明
第２９回メディシナルケミストリーシンポジウム, Nov. 2010, Not invited - FMO法を用いた抗インフルエンザ薬とNAとの理論的相互作用解析７
酒井美帆、山岸賢司、鈴木康夫、常盤広明
第２９回メディシナルケミストリーシンポジウム, Nov. 2010, Not invited - 部分構造最適化法を利用したab initioドッキング法の開発４
元吉沙也加、山岸賢司、山田幸子; 常盤広明
第２９回メディシナルケミストリーシンポジウム, Nov. 2010, Not invited - ヒトパラインフルエンザウイルス（hPIV）感染症新規治療薬の理論的分子設計２
伊東祐仁、山岸賢司、池田潔、鈴木隆、常盤広明
第５４回日本薬学会関東支部大会, Oct. 2010, Not invited - FMO法を用いた抗インフルエンザ薬とNAとの理論的相互作用解析５
酒井美帆、山岸賢司、鈴木康夫、常盤広明
第５４回日本薬学会関東支部大会, Oct. 2010, Not invited - FMO-ONIOM法を用いたab initioドッキング法の開発と応用3
元吉沙也加、山岸賢司、槇島誠、山田幸子; 常盤広明
第５４回日本薬学会関東支部大会, Oct. 2010, Not invited - PPARのデュアルおよびパンアゴニストに関する理論的研究
花田典佳、元吉沙也加、山岸賢司、宮地弘幸、常盤広明
第５４回日本薬学会関東支部大会, Oct. 2010, Not invited - 免疫応答における細胞膜表面糖鎖のはたらきに関する理論的研究
鈴木悠人、伊東祐仁、山岸賢司、池田潔、常盤広明
第５４回日本薬学会関東支部大会, Oct. 2010, Not invited - Theoretical interaction analysis between influenza neuraminidase and anti-influenza drugs using Fragment MO method
Kenji Yamagishi; Miho Sakai; Yasuo Suzuki; Hiroaki Tokiwa
The 25th International Carbohydrate Symposium (ICS2010), Sep. 2010, Not invited - ヒトパラインフルエンザウイルス(hPIV)感染症の新規治療薬の理論的分子設計
伊東祐仁、山岸賢司、池田潔、鈴木隆、常盤広明
日本プロセス科学科医2010サマーシンポジウム, Jul. 2010, Not invited - リガンドを介した1,25(OH)2D3/VDRのアロステリックコミュニケーション
元吉沙也加、山岸賢司、槇島誠、山田幸子、常盤広明
日本ビタミン学会第62大会, Jun. 2010, Not invited - FMO法を用いたPPARγリガンドの構造毒性相関
宗像 紫織、元吉 沙也加、山岸 賢司、山田 幸子、青木 康展、白石 寛明、常盤 広明
第37回日本トキシコロジー学会, Jun. 2010, Not invited - ハイスループット創薬を志向したIT分子設計の“ニュートレンド
常盤広明、山岸賢司
第9回国際バイオEXPO, May 2010, Not invited - トリプトファン誘導体のIDO転写調節に及ぼすインドール環上の電荷密度の影響
岡本威明; 山岸賢司; 山倉文幸; 常盤広明; 日高和夫
日本農芸化学会2010大会, Mar. 2010, Not invited - PPAR- リガンド複合体に関する理論的研究2
宗像紫織,元吉沙也加,山岸賢司,山田幸子,青木康展,白石寛明,常盤広明
日本薬学会第130年会, Mar. 2010, Not invited - IDO転写調節機能を有するトリプトファン誘導体に関する理論的研究
山岸賢司; 岡本威明; 麻生琴未; 山倉文幸; 日高和夫; 常盤広明
日本薬学会第130年会, Mar. 2010, Not invited - 部分構造最適化法を利用したab initioドッキング法の開発３
元吉沙也加、山岸賢司、山田幸子、常盤広明
日本薬学会第130年会, Mar. 2010, Not invited - フラグメント分子軌道法を用いた抗インフルエンザ薬とNAとの理論的相互作用解析 ４
酒井美帆; 山岸賢司; 鈴木康夫; 常盤広明
日本薬学会第130年会, Mar. 2010, Not invited - 抗パラインフルエンザウイルス活性を有するシアル酸誘導体の理論的研究 ２
伊東祐仁; 山岸賢司; 池田潔; 鈴木隆; 常盤広明
日本薬学会第130年会, Mar. 2010, Not invited - 作用選択的なビタミンDリガンドに関する理論的研究
元吉沙也加; 山岸賢司; 槇島誠; 山田幸子; 常盤広明
日本薬学会第130年会, Mar. 2010, Not invited - フラグメント分子軌道法を用いた抗ｲﾝﾌﾙｴﾝｻﾞ薬とNAとの理論的相互作用解析3
酒井美帆、山岸賢司、鈴木康夫、常盤広明
第32回分子生物学会年会, Dec. 2009, Not invited - 作用選択的なビタミンDリガンドに関する理論的研究2
元吉沙也加; 山岸賢司; 槇島誠; 山田幸子; 常盤広明
第28回ﾒﾃﾞｨｼﾅﾙｹﾐｽﾄﾘｰｼﾝﾎﾟｼﾞｳﾑ, Nov. 2009, Not invited - 受容体－化学物質間相互作用解析に基づく生体毒性予測システムの開発
常盤広明、青木康展、山田幸子、山岸賢司
国立環境研究所 平成21年度スーパーコンピュータ利用研究報告会, Nov. 2009, Not invited - 部分構造最適化法を利用したab initioドッキング法の開発2
元吉沙也加; 山岸賢司; 山田幸子; 常盤広明
第28回ﾒﾃﾞｨｼﾅﾙｹﾐｽﾄﾘｰｼﾝﾎﾟｼﾞｳﾑ, Nov. 2009, Not invited - In Silico Molecular Screening of Novel Vitamin D Ligands
Kenji Yamagishi; Sachiko Yamada; Makoto Makishima; Hiroaki Tokiwa
14th Workshop on Vitamin D, Oct. 2009, Not invited - Application of ab initio docking procedure based on FMO-ONIOM method to novel VDR ligands”
Sayaka Motoyoshi; Kenji Yamagishi; Sachiko Yamada; Makoto Makishima; Hiroaki Tokiwa
14th Workshop on Vitamin D, Oct. 2009, Not invited - X-RAY Crystal Structure, Biological Activity and Structure-Activity Relationship of Novel Vitamin D Partial Agonist/Antagonist
Sachiko Yamada; Makoto Nakabayashi; Teikichi Ikura; Nobutoshi Ito; Nobuko Yoshimoto; Masato Shimizu; Kenji Yamagishi; Takeru Kudo; Hiroaki Tokiwa; Mihwa Chuma; Makoto Makishima
14th Workshop on Vitamin D, Oct. 2009, Not invited - フラグメント分子軌道法を用いた抗インフルエンザ薬とN1型NAとの理論的相互作用解析
山岸賢司、酒井美帆、鈴木康夫、常盤広明
第29回日本糖質学会, Sep. 2009, Not invited - 環境ホルモン物質に対する定量的構造活性相関
山岸賢司
川崎医科大学自然科学教室公開セミナー, Sep. 2009, Not invited - Development and Application of ab initio Docking Procedure Based on the FMO-ONIOM Method
Sayaka Motoyoshi; Kenji Yamagishi; Sachiko Yamada; Hiroaki Tokiwa
CREST International Symposium on Theory And Simulations of Complex Molecular Systems, Jul. 2009, Not invited - ハイスループット創薬を志向したIT分子設計の“ニュートレンド
常盤広明、山岸賢司
第4回医薬品原料国際展(ﾌｧｰﾏｼﾞｬﾊﾟﾝ)併催第8回国際バイオEXPO, May 2009, Not invited - 部分構造最適化法を利用したab initioドッキング法の開発2
元吉沙也加、山岸賢司、槇島誠、山田幸子、常盤広明
日本薬学会第129年会, Mar. 2009, Not invited - 新規創薬手法を用いビタミンD受容体と各種リガンドとの相互作用解析II
山岸賢司、山田幸子、槇島誠、常盤広明
日本薬学会第129年会, Mar. 2009, Not invited - 作用選択的なビタミンＤリガンドに関する理論的研究
元吉沙也加、山岸賢司、槇島誠、山田幸子、常盤広明
日本薬学会第129年会, Mar. 2009, Not invited - Protein Structure and Drug Discovery
Kenji Yamagishi
MolSoft ICM WorkShop, Feb. 2009, Not invited - 配位子（リガンド）とタンパク質との分子相互作用に関する理論的研究
山岸賢司、常盤広明
立教大学学術フロンティア報告会, Jan. 2009, Not invited - Theoretical Study of Partial Agonist Ligands of Vitamin D Receptor (VDR): 19-nor Vitamin D3 Analogues
Sayaka Motoyoshi; Kenji Yamagishi; Sachiko Yamada; Hiroaki Tokiwa
The Eighth China-Japan Joint Symposium On Drug Design and Development, Nov. 2008, Not invited - 新規創薬手法を用いビタミンD受容体と各種リガンドとの相互作用解析
山岸賢司、山田幸子、槇島誠、常盤広明
第27回メディシナルケミストリーシンポジウム, Nov. 2008, Not invited - 部分構造最適化法を利用したab initioドッキング法の開発
元吉沙也加、山岸賢司、山田幸子、常盤広明
第27回メディシナルケミストリーシンポジウム, Nov. 2008, Not invited - Theoretical Study of Partial Agonist Ligands of Vitamin D Receptor(VDR):19-nor VitaminD3 Analogues
Sayaka Motoyoshi; Kenji Yamagishi; Makoto Makishima; Sachiko Yamada; Hiroaki Tokiwa
第36回構造活性相関シンポジウム, Nov. 2008, Not invited - 新規ドッキング手法の作用選択的ビタミンDリガンドへの応用
元吉沙也加、山岸賢司、槇島誠、山田幸子、常盤広明
第52回日本薬学会関東支部大会, Oct. 2008, Not invited - ab initio ドッキング法を基盤とした新規in silico創薬手法の開発とその応用
元吉沙也加、山岸賢司、槇島誠、山田幸子、常盤広明
生体機能と創薬ｼﾝﾎﾟｼﾞｳﾑ, Sep. 2008, Not invited - FMO法を基盤とした新規創薬手法の開発とインフルエンザウィルスなどへの適用
山岸賢司、澤田敏彦、橋本智裕、木曾誠、鈴木康夫、常盤広明
日本薬学会第128年会, Mar. 2008, Not invited - ビタミンＤ受容体の各アミノ酸残基の機能特定
山岸賢司、山本恵子、山田幸子、常盤広明
日本薬学会第128年会, Mar. 2008, Not invited - FMO法を用いたVDR/2MD複合体に関する理論的研究５
大塚智世、山岸賢司、山本恵子、山田幸子、常盤広明
日本薬学会第128年会, Mar. 2008, Not invited - FMO法を用いたVDR/2MD複合体に関する理論的研究４
大塚智世、山岸賢司、山本恵子、山田幸子、常盤広明
第35回構造活性相関シンポジウム, Nov. 2007, Not invited - QSAR Study of Cyclic Urea Type HIV-1 PR Inhibitors Using Ab Initio MO Calculation of Their Complex Structure with HIV-1 PR
Tatsusada Yoshida; Kenji Yamagishi; Hiroshi Chuman
情報計算科学生物学会, Oct. 2007, Not invited - Interaction Analysis Between Artificial Ligands and Target Receptor for Osteolytic Bone Disease based on a Novel Computer Assisted System
Tomoyo Otsuka; Kenji Yamagishi; Keiko Yamamoto; Sachiko Yamada; Hiroaki Tokiwa
5th International Symposium on Receptor Mechanisms, May 2007, Not invited - Function of the key residues in the ligand-binding pocket of vitamin D receptor
Kenji Yamagishi; Keiko Yamamoto; Sachiko Yamada; Hiroaki Tokiwa
5th International Symposium on Receptor Mechanisms, May 2007, Not invited - FMO法を用いたVDR/2MD複合体に関する理論的研究３
大塚智世、山岸賢司、山本恵子、山田幸子、常盤広明
日本薬学会第127年会, Mar. 2007, Not invited - フラグメント分子軌道法を用いたHIV-1 proteaseと阻害剤との相互作用解析
山岸賢司、吉田達貞、川和田美里、常盤広明、中馬寛
第34回構造活性相関シンポジウム, Nov. 2006, Not invited - FMO法を用いたVDR/2MD複合体に関する理論的研究
常盤広明、大塚智世、山岸賢司、山本恵子、山田幸子
第34回構造活性相関シンポジウム, Nov. 2006, Not invited - FMO法を用いたVDR/2MD複合体に関する理論的研究２
大塚智世、山岸賢司、山本恵子、山田幸子、常盤広明
第34回構造活性相関シンポジウム, Nov. 2006, Not invited - Function of the key residues in the ligand-binding pocket of vitamin D receptor: Fragment molecular orbital -interfragment interaction energy analysis
Kenji Yamagishi; Keiko Yamamoto; Sachiko Yamada; Hiroaki Tokiwa
Chem-Bio Infomatics Society Annual Meeting 2006, Jul. 2006, Not invited - Ab initio fragment molecular orbital method and its application to biomolecular systems
Kenji Yamagishi
Asia Hub for e-Drug Discovery Symposium, May 2006, Invited - FMO法を基盤とした新規創薬手法の開発と応用
山岸賢司、山本恵子、石川岳志、望月祐二、中野達也、山田幸子、常盤広明
日本薬学会第126年会, Mar. 2006, Not invited - FMO-IFIE法を用いたVDR中のLBP残基の機能特定
山岸賢司、山本恵子、山田幸子、常盤広明
日本薬学会第126年会, Mar. 2006, Not invited - FMO法を用いたVDR/2MD複合体に関する理論的研究
大塚智世、山岸賢司、山本恵子、山田幸子、常盤広明
日本薬学会第126年会, Mar. 2006, Not invited - HIV-1 PR阻害剤のファーマコフォアに関する理論的研究
川和田美里、山岸賢司、寺前裕之、中馬寛、常盤広明
日本薬学会第126年会, Mar. 2006, Not invited - 高次元アルゴリズムに基づくタンパク質の動的コンフォメーション解析
芳野聡哉、山岸賢司、寺前裕之、常盤広明
日本薬学会第126年会, Mar. 2006, Not invited - Quantitative structure-activity relationship analysis of HIV-1 PR inhibitors including dynamical conformation change
Misato Kawawada; Kenji Yamagishi; Hiroyuki Teramae; Hiroshi Chuman; Hiroaki Tokiwa
The 2006 International Chemical Congress of Pacific Basin Societies, Dec. 2005, Not invited - フラグメント分子軌道法によるビタミンＤレセプターとリガンドとの相互作用解析
斉藤悠、山岸賢司、山本恵子、山田幸子、常盤広明
日本薬学会第125年会, Mar. 2005, Not invited - 動的コンフォメーション解析を取り入れたHIV-1 PR阻害薬の構造活性相関II
川和田美里、山岸賢司、寺前裕之、中馬寛、常盤広明
日本薬学会第125年会, Mar. 2005, Not invited - 環境ホルモン；エストロジェン様化合物の構造活性相関に関する理論的研究VI
山岸賢司、常盤広明、長嶋雲兵
第32回構造活性相関シンポジウム, Nov. 2004, Not invited - 動的コンフォメーション解析を取り入れたHIV-1 PR阻害薬の構造活性相関I
川和田美里、山岸賢司、寺前裕之、中馬寛、常盤広明
第23回メディシナルケミストリーシンポジウム, Nov. 2004, Not invited - ニューラルネットワーク法による新規logP, Solubility, pKa推算式の構築
山岸賢司、田島澄恵、八木徹、原口誠、常盤広明、長嶋雲兵
情報計算科学生物学会, Jul. 2004, Not invited - ニューラルネットワーク法による新規logP, Solubility, pKa推算式の構築
山岸賢司、田島澄恵、原口誠、長嶋雲兵、常盤広明
日本薬学会第124年会, Mar. 2004, Not invited - 環境ホルモン；エストロジェン様化合物の構造活性相関に関する理論的研究V
山岸賢司、常盤広明、長嶋雲兵
日本薬学会第124年会, Mar. 2004, Not invited - ニューラルネットワーク法を利用した物性(logP, Solubility, pKa)予測
山岸賢司、田島澄恵、原口誠、長嶋雲兵
第31回構造活性相関シンポジウム, Nov. 2003, Not invited - 環境ホルモン；エストロジェン様化合物の構造活性相関に関する理論的研究IV
山岸賢司、原田隆範、常盤広明、長嶋雲兵
第31回構造活性相関シンポジウム, Nov. 2003, Not invited - 動的コンフォメーション変化を考慮した抗HIV薬のQSAR解析
川和田美里、山岸賢司、寺前裕之、中馬寛、常盤広明
第31回構造活性相関シンポジウム, Nov. 2003, Not invited - ニューラルネットワーク法による新規logP推算式の構築
田島澄恵、山岸賢司、原口誠、長嶋雲兵
情報計算科学生物学会, Sep. 2003, Not invited - 環境ホルモン；エストロジェン様化合物の構造活性相関に関する理論的研究III
山岸賢司、原田隆範、常盤広明、中野達也、長嶋雲兵
第30回構造活性相関シンポジウム, Nov. 2002, Not invited - フラグメント分子軌道法によるプロゲステロン受容体－リガンド間相互作用解析
原田隆範、山岸賢司、中野達也、常盤広明
分子構造総合討論会, Nov. 2002, Not invited - Interaction analysis between progesterone receptor and their ligands by fragment molecular orbital method
Takanori Harada; Kenji Yamagishi; Hiroaki Tokiwa; Tatsuya Nakano
6th World Congress of Theoretically Oriented Chemists, Aug. 2002, Not invited - Theoretical Study on QSARAnalysis for Endocrine Disruptors
Kenji Yamagishi; Takanori Harada; Tatsuya Nakano; Hiroaki Tokiwa
6th World Congress of Theoretically Oriented Chemists, Aug. 2002, Not invited - 環境ホルモン；エストロジェン様化合物の構造活性相関に関する理論的研究II
山岸賢司、常盤広明、中野達也、長嶋雲兵
日本薬学会第122年会, Mar. 2002, Not invited - 環境ホルモン；エストロジェン様化合物の構造活性相関に関する理論的研究
山岸賢司、常盤広明、中野達也、長嶋雲兵
第29回構造活性相関シンポジウム, Nov. 2001, Not invited
Affiliated academic society
Research Themes
- 分子シミュレーションによる新規RNAアプタマー設計の基盤技術の構築
日本学術振興会, 科学研究費補助金 基盤研究(C), Apr. 2021 - Mar. 2024 - 計算化学的手法による抗体と糖鎖の相互作用解析
Apr. 2022 - Mar. 2023 - 計算化学を基盤としたアプタマーの革新的デザイン技術の開発
科学技術振興機構, 研究成果最適展開支援プログラム（A-step） トライアウトタイプ, May 2021 - Mar. 2022 - 計算化学手法を用いた新規RNAアプタマー設計手法の開発と応用
日本大学, 日本大学学術研究助成金, Apr. 2019 - Mar. 2021 - RNAアプタマーの分子認識メカニズムの解明
日本学術振興会, 科学研究費補助金 基盤研究(C), Apr. 2018 - Mar. 2021 - 分子シミュレーション解析によるRNAアプタマーの標的分子認識メカニズムの解明
日本大学, 日本大学工学部長指定研究費, Apr. 2018 - Mar. 2019 - 計算化学手法による革新的な抗体精製用RNAアプタマーの開発
科学技術振興機構, 研究成果展開事業 地域産学バリュープログラム, Dec. 2017 - Nov. 2018 - 計算化学手法を用いた新規RNA アプタマーの設計手法の開発
日本大学, 日本大学工学部長指定研究費, Apr. 2017 - Mar. 2018 - ハロゲン原子の導入によるタンパク質の構造安定化メカニズムの解明
日本学術振興会, 科学研究費補助金 若手研究(B), Apr. 2016 - Mar. 2018 - 計算化学手法を用いた新規RNA アプタマーの設計手法の開発
科学技術振興機構, 研究成果展開事業マッチングプランナープログラム 第1回探索試験, Oct. 2015 - Sep. 2016 - Identification of biomarker for pathogenesis on asthma and COPD based on airway secreted exosome
Japan Society for the Promotion of Science, Grants-in-Aid for Scientific Research, 01 Apr. 2015 - 31 Mar. 2018
GON yasuhiro - A
日本大学, 日本大学工学部長指定研究費, Apr. 2017 - Mar. 2018 - ハロゲン原子導入によるタンパク質の構造安定化メカニズムの解明
日本大学, 日本大学工学部長指定研究費, Apr. 2016 - Mar. 2017 - ハロゲン化チロシンの導入によるタンパク質の構造安定化メカニズムの解明
日本大学, 日本大学工学部長指定研究費, Apr. 2015 - Mar. 2016 - 非天然型アミノ酸導入によるタンパク質の構造安定化メカニズムの解明
日本大学, 日本大学工学部長指定研究費（特別研究）, Apr. 2014 - Mar. 2015 - アミノ酸レパートリーの拡張によるタンパク質の新規構築原理の解明と応用
日本大学, 日本大学工学部研究費, Apr. 2013 - Mar. 2014 - ビタミンＤ受容体の作用機序の解明と医薬品開発への応用
日本大学, 日本大学工学部研究費, Apr. 2012 - Mar. 2013
